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Ebola Virus Computational Resources (EbolaVCR) is the in silico resources developed to facilitate scientific community fighting against deadly virus EBOLA. This server enlists possible vaccine candidates, therapeutic siRNAs and other related resources.
Reference: Dhanda et. al. (2016) A web-based resource for designing therapeutics against Ebola Virus. Sci Rep. 6:24782.
AntigenssGP
StrainEbola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)
Number of strain3
Gene IDgi_10313996
Protein IDNP_066248.1
Mapped EpitopeVisualize
Sequence conservationVisualize Alignment
IDstartPeptideCTLMHC I allelesMHC I allele CountHLA allelesHLA allele Count MHC II allelesMHC II allele CountB cell epitopeInterferon-gamma inducerInterleukin-4 stimulator
24728Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)153 FHKEGAFFL YHLA-A2.1, HLA-B*3701, HLA-B*3801, HLA-B*3901, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B88HLA-A2, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0110DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_01056N0.08
24735Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)160 FLYDRLAST NHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2.1, HLA-A3, HLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*51, HLA-B*5401, HLA-B62, HLA-B810NA0DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_11077N0.10
24602Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)27 FQRTFSIPL YHLA-A*0205, HLA-A2.1, HLA-B*0702, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3501, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B60, HLA-B62, HLA-B7, HLA-B8, HLA-Cw*060215HLA-B27, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0110DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_010512N0.41
24599Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)24 IILFQRTFS NNA0NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_150632N0.16
24600Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)25 ILFQRTFSI YHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-A2.1, HLA-A3, HLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B62, HLA-B8, MHC-Dd, MHC-Kk19HLA-A2, HLA-A*1101, HLA-A3, HLA-A*0301, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*01, HLA-A*680114DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_132828N0.31
24608Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)33 IPLGVIHNS YHLA-B*3501, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, MHC-Ld5HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*019DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_03114N0.14
24704Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)129 IRGFPRCRY NHLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-Cw*07025NA0DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_150628N0.30
24793Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)218 IRYQATGFG NHLA-B*2702, HLA-B*27052NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_132829N0.39
24645Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)70 LEGNGVATD NNA0NA0DRB1_0806, DRB1_13042N0.99
24686Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)111 LEIKKPDGS NHLA-B40, HLA-B*4403, HLA-B61, MHC-Kk4NA0DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_13227N0.06
24610Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)35 LGVIHNSTL NHLA-B14, HLA-B*3902, HLA-B40, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B60, HLA-B7, HLA-Cw*0301, MHC-Db, MHC-Db revised, MHC-Dd, MHC-Kd15NA0DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_15069N0.88
24576Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)1 MGVTGILQL NHLA-B14, HLA-B*3901, HLA-B*3902, HLA-B40, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B60, HLA-B7, HLA-Cw*0301, HLA-Cw*0401, MHC-Db, MHC-Db revised, MHC-Dd, MHC-Kd, MHC-Ld18NA0DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_15063N0.31
24612Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)37 VIHNSTLQV NHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-B*51, HLA-B*5103, HLA-B*53016NA0DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_150626N0.36
24744Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)169 VIYRGTTFA NHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*54016NA0DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_132210N0.13
24654Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)79 VPSATKRWG NHLA-B*511NA0DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_13283N0.99
24671Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)96 VVNYEAGEW NHLA-B*511NA0DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_15067N0.11
24737Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)162 YDRLASTVI NHLA-B*3701, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, MHC-Kk5NA0DRB1_0101, DRB1_04082N0.31
24712Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)137 YVHKVSGTG NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_08176N0.99
24788Ebola Virus Mayinga Zaire(EBOV-May)213 YYSTTIRYQ NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_13234N0.04